氨气是畜禽舍内有害气体之一，畜禽长期处于高度氨的环境下，会造成氨的慢性中毒，体质变弱，抵抗力降低，采食量、日增重、生殖能力下降，发病率、死亡率、死亡率升高。高浓度的氨，可造成氨中毒，引起中枢神经麻痹、中毒性肝病和心肌损伤等明显病理反应和症状。如畜舍内的氨含量为50mg/m3水平的时候，小猪的生长效率减少12%。
畜舍内的氨气主要源于动物代谢。畜舍内的氨气另外一个来源是舍内环境，如饲料残渣和垫草等有机物腐败分解而产生氨。畜舍内中氨气的含量与舍内温度、饲养密度、通风情况、地面结构、饲养管理水平、粪污清除等有关。氨气在畜舍中常被溶解或吸附在潮湿的地面、墙壁和家畜粘膜上，当舍内温度升高时，溶解在说中的氨与水分分离，对空气形成二次污染，并会再次附着在家畜的黏膜上，对畜禽造成危害，因此，必须加强生产管理，降低氨气的产生和排放，促进禽畜生产性能的提高，降低对环境的影响。
空气中的氨气以及硫化氢易粘附在动物黏膜的上皮细胞，过高的畜舍氨气会影响动物的呼吸道黏膜以及眼结膜的完整性，诱发各种呼吸道疾病，导致动物生长性能的下降。
肠道氨气透过肠粘膜进入动物血液，与血红蛋白结合降低了血红蛋白与氧气的结合能力，同时使血液中的pH升高，降低氧合血红蛋白流经组织时氧气的释放（氧离曲线）（Ville C, et al, 1992），对快大肉鸡来讲会诱发腹水症（Walker, 1994a, Walker 1994b）。对怀孕家畜会因血氧不足导致早产或死胎。
